Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPR5

Hdgfl1, Hepatoma-derived growth factor-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl1Q2VPR5 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms