Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms