Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim71Q1PSW8 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms