Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

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Length 617 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
VgfQ0VGU4 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VgfQ0VGU4 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VgfQ0VGU4 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VgfQ0VGU4 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VgfQ0VGU4 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VgfQ0VGU4 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VgfQ0VGU4 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VgfQ0VGU4 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VgfQ0VGU4 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VgfQ0VGU4 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VgfQ0VGU4 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VgfQ0VGU4 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VgfQ0VGU4 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VgfQ0VGU4 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
VgfQ0VGU4 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VgfQ0VGU4 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VgfQ0VGU4 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VgfQ0VGU4 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VgfQ0VGU4 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VgfQ0VGU4 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VgfQ0VGU4 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VgfQ0VGU4 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VgfQ0VGU4 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VgfQ0VGU4 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
VgfQ0VGU4 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VgfQ0VGU4 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VgfQ0VGU4 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VgfQ0VGU4 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
VgfQ0VGU4 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VgfQ0VGU4 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VgfQ0VGU4 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VgfQ0VGU4 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VgfQ0VGU4 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VgfQ0VGU4 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VgfQ0VGU4 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VgfQ0VGU4 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VgfQ0VGU4 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VgfQ0VGU4 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VgfQ0VGU4 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VgfQ0VGU4 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VgfQ0VGU4 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
VgfQ0VGU4 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
VgfQ0VGU4 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VgfQ0VGU4 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VgfQ0VGU4 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
VgfQ0VGU4 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VgfQ0VGU4 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VgfQ0VGU4 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VgfQ0VGU4 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VgfQ0VGU4 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VgfQ0VGU4 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VgfQ0VGU4 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VgfQ0VGU4 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VgfQ0VGU4 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
VgfQ0VGU4 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VgfQ0VGU4 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VgfQ0VGU4 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VgfQ0VGU4 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VgfQ0VGU4 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VgfQ0VGU4 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VgfQ0VGU4 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VgfQ0VGU4 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VgfQ0VGU4 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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VgfQ0VGU4 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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VgfQ0VGU4 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VgfQ0VGU4 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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VgfQ0VGU4 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VgfQ0VGU4 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VgfQ0VGU4 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VgfQ0VGU4 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VgfQ0VGU4 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VgfQ0VGU4 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VgfQ0VGU4 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VgfQ0VGU4 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VgfQ0VGU4 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VgfQ0VGU4 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VgfQ0VGU4 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VgfQ0VGU4 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VgfQ0VGU4 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VgfQ0VGU4 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VgfQ0VGU4 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VgfQ0VGU4 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VgfQ0VGU4 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VgfQ0VGU4 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VgfQ0VGU4 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
VgfQ0VGU4 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VgfQ0VGU4 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VgfQ0VGU4 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VgfQ0VGU4 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
VgfQ0VGU4 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VgfQ0VGU4 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VgfQ0VGU4 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VgfQ0VGU4 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms