Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms