Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE29

Samd12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd12Q0VE29 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms