Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF2

Tmem52b, Transmembrane protein 52B, mousemouse

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Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem52bQ0VBF2 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem52bQ0VBF2 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem52bQ0VBF2 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem52bQ0VBF2 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem52bQ0VBF2 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem52bQ0VBF2 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem52bQ0VBF2 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem52bQ0VBF2 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem52bQ0VBF2 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem52bQ0VBF2 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem52bQ0VBF2 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem52bQ0VBF2 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem52bQ0VBF2 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem52bQ0VBF2 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem52bQ0VBF2 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem52bQ0VBF2 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem52bQ0VBF2 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem52bQ0VBF2 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem52bQ0VBF2 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem52bQ0VBF2 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem52bQ0VBF2 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem52bQ0VBF2 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem52bQ0VBF2 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem52bQ0VBF2 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem52bQ0VBF2 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem52bQ0VBF2 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem52bQ0VBF2 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem52bQ0VBF2 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Tmem52bQ0VBF2 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Tmem52bQ0VBF2 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Tmem52bQ0VBF2 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmem52bQ0VBF2 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmem52bQ0VBF2 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmem52bQ0VBF2 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmem52bQ0VBF2 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmem52bQ0VBF2 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmem52bQ0VBF2 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmem52bQ0VBF2 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmem52bQ0VBF2 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmem52bQ0VBF2 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmem52bQ0VBF2 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmem52bQ0VBF2 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmem52bQ0VBF2 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmem52bQ0VBF2 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmem52bQ0VBF2 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmem52bQ0VBF2 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmem52bQ0VBF2 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmem52bQ0VBF2 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmem52bQ0VBF2 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmem52bQ0VBF2 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmem52bQ0VBF2 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmem52bQ0VBF2 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmem52bQ0VBF2 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmem52bQ0VBF2 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmem52bQ0VBF2 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmem52bQ0VBF2 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmem52bQ0VBF2 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmem52bQ0VBF2 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem52bQ0VBF2 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem52bQ0VBF2 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem52bQ0VBF2 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem52bQ0VBF2 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem52bQ0VBF2 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem52bQ0VBF2 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem52bQ0VBF2 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem52bQ0VBF2 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem52bQ0VBF2 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem52bQ0VBF2 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem52bQ0VBF2 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem52bQ0VBF2 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem52bQ0VBF2 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem52bQ0VBF2 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem52bQ0VBF2 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem52bQ0VBF2 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem52bQ0VBF2 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem52bQ0VBF2 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem52bQ0VBF2 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem52bQ0VBF2 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem52bQ0VBF2 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem52bQ0VBF2 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem52bQ0VBF2 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem52bQ0VBF2 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem52bQ0VBF2 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem52bQ0VBF2 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem52bQ0VBF2 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem52bQ0VBF2 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem52bQ0VBF2 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem52bQ0VBF2 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem52bQ0VBF2 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem52bQ0VBF2 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem52bQ0VBF2 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem52bQ0VBF2 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem52bQ0VBF2 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem52bQ0VBF2 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem52bQ0VBF2 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem52bQ0VBF2 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem52bQ0VBF2 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem52bQ0VBF2 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem52bQ0VBF2 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem52bQ0VBF2 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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