Protein–RNA interactions for Protein: Q0P678

Zc3h18, Zinc finger CCCH domain-containing protein 18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h18Q0P678 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zc3h18Q0P678 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zc3h18Q0P678 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zc3h18Q0P678 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zc3h18Q0P678 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zc3h18Q0P678 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zc3h18Q0P678 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zc3h18Q0P678 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zc3h18Q0P678 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zc3h18Q0P678 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zc3h18Q0P678 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zc3h18Q0P678 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zc3h18Q0P678 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zc3h18Q0P678 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zc3h18Q0P678 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Zc3h18Q0P678 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zc3h18Q0P678 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Zc3h18Q0P678 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zc3h18Q0P678 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zc3h18Q0P678 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zc3h18Q0P678 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zc3h18Q0P678 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zc3h18Q0P678 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zc3h18Q0P678 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zc3h18Q0P678 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zc3h18Q0P678 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zc3h18Q0P678 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zc3h18Q0P678 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zc3h18Q0P678 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zc3h18Q0P678 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zc3h18Q0P678 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zc3h18Q0P678 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zc3h18Q0P678 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zc3h18Q0P678 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zc3h18Q0P678 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zc3h18Q0P678 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zc3h18Q0P678 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zc3h18Q0P678 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zc3h18Q0P678 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zc3h18Q0P678 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zc3h18Q0P678 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zc3h18Q0P678 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zc3h18Q0P678 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zc3h18Q0P678 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zc3h18Q0P678 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zc3h18Q0P678 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Zc3h18Q0P678 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zc3h18Q0P678 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zc3h18Q0P678 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zc3h18Q0P678 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zc3h18Q0P678 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zc3h18Q0P678 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zc3h18Q0P678 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zc3h18Q0P678 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zc3h18Q0P678 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zc3h18Q0P678 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zc3h18Q0P678 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zc3h18Q0P678 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zc3h18Q0P678 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zc3h18Q0P678 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zc3h18Q0P678 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Zc3h18Q0P678 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zc3h18Q0P678 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zc3h18Q0P678 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zc3h18Q0P678 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms