Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms