Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

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Length 804 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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