Protein–RNA interactions for Protein: Q08AU9

UPF0450 protein C17orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q08AU9 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q08AU9 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q08AU9 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q08AU9 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q08AU9 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q08AU9 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q08AU9 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q08AU9 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q08AU9 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q08AU9 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Q08AU9 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q08AU9 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q08AU9 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q08AU9 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q08AU9 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q08AU9 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q08AU9 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q08AU9 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q08AU9 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q08AU9 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q08AU9 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q08AU9 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q08AU9 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q08AU9 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q08AU9 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q08AU9 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q08AU9 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q08AU9 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q08AU9 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Q08AU9 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Q08AU9 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Q08AU9 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q08AU9 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q08AU9 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Q08AU9 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Q08AU9 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q08AU9 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Q08AU9 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q08AU9 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q08AU9 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q08AU9 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Q08AU9 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Q08AU9 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q08AU9 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Q08AU9 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Q08AU9 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q08AU9 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q08AU9 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q08AU9 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q08AU9 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q08AU9 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q08AU9 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Q08AU9 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Q08AU9 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q08AU9 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q08AU9 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q08AU9 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q08AU9 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q08AU9 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q08AU9 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q08AU9 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q08AU9 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q08AU9 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q08AU9 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q08AU9 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q08AU9 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q08AU9 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Q08AU9 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Q08AU9 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Q08AU9 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q08AU9 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q08AU9 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q08AU9 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Q08AU9 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q08AU9 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q08AU9 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q08AU9 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q08AU9 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q08AU9 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q08AU9 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q08AU9 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q08AU9 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q08AU9 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q08AU9 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q08AU9 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q08AU9 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q08AU9 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q08AU9 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Q08AU9 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q08AU9 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q08AU9 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q08AU9 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q08AU9 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q08AU9 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q08AU9 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q08AU9 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q08AU9 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q08AU9 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q08AU9 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q08AU9 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms