Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms