Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnn2Q08093 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnn2Q08093 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnn2Q08093 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnn2Q08093 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnn2Q08093 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnn2Q08093 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnn2Q08093 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cnn2Q08093 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cnn2Q08093 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cnn2Q08093 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cnn2Q08093 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cnn2Q08093 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cnn2Q08093 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cnn2Q08093 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms