Protein–RNA interactions for Protein: Q07802

Ebf1, Transcription factor COE1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf1Q07802 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ebf1Q07802 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ebf1Q07802 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ebf1Q07802 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ebf1Q07802 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ebf1Q07802 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ebf1Q07802 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ebf1Q07802 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ebf1Q07802 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ebf1Q07802 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ebf1Q07802 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ebf1Q07802 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ebf1Q07802 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ebf1Q07802 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ebf1Q07802 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ebf1Q07802 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ebf1Q07802 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ebf1Q07802 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ebf1Q07802 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ebf1Q07802 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ebf1Q07802 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ebf1Q07802 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ebf1Q07802 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ebf1Q07802 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ebf1Q07802 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ebf1Q07802 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ebf1Q07802 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ebf1Q07802 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ebf1Q07802 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ebf1Q07802 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ebf1Q07802 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ebf1Q07802 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ebf1Q07802 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ebf1Q07802 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ebf1Q07802 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ebf1Q07802 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ebf1Q07802 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ebf1Q07802 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ebf1Q07802 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ebf1Q07802 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ebf1Q07802 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ebf1Q07802 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ebf1Q07802 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ebf1Q07802 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ebf1Q07802 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ebf1Q07802 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ebf1Q07802 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ebf1Q07802 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ebf1Q07802 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ebf1Q07802 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ebf1Q07802 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ebf1Q07802 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ebf1Q07802 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ebf1Q07802 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ebf1Q07802 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ebf1Q07802 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ebf1Q07802 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ebf1Q07802 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ebf1Q07802 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ebf1Q07802 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ebf1Q07802 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ebf1Q07802 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ebf1Q07802 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ebf1Q07802 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ebf1Q07802 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ebf1Q07802 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ebf1Q07802 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ebf1Q07802 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ebf1Q07802 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ebf1Q07802 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ebf1Q07802 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ebf1Q07802 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ebf1Q07802 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ebf1Q07802 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ebf1Q07802 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ebf1Q07802 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ebf1Q07802 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ebf1Q07802 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ebf1Q07802 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ebf1Q07802 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ebf1Q07802 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ebf1Q07802 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ebf1Q07802 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ebf1Q07802 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ebf1Q07802 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ebf1Q07802 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ebf1Q07802 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ebf1Q07802 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ebf1Q07802 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ebf1Q07802 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ebf1Q07802 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ebf1Q07802 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ebf1Q07802 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ebf1Q07802 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ebf1Q07802 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ebf1Q07802 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ebf1Q07802 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ebf1Q07802 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ebf1Q07802 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ebf1Q07802 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms