Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms