Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms