Protein–RNA interactions for Protein: Q07279

Nfe2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2Q07279 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms