Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms