Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms