Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

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Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Cab39Q06138 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Cab39Q06138 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Cab39Q06138 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Cab39Q06138 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Cab39Q06138 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Cab39Q06138 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Cab39Q06138 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Cab39Q06138 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Cab39Q06138 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Cab39Q06138 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Cab39Q06138 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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