Protein–RNA interactions for Protein: Q04899

Cdk18, Cyclin-dependent kinase 18, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk18Q04899 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdk18Q04899 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdk18Q04899 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdk18Q04899 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdk18Q04899 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdk18Q04899 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdk18Q04899 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdk18Q04899 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdk18Q04899 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdk18Q04899 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdk18Q04899 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdk18Q04899 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdk18Q04899 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdk18Q04899 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdk18Q04899 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdk18Q04899 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdk18Q04899 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdk18Q04899 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdk18Q04899 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdk18Q04899 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdk18Q04899 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdk18Q04899 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdk18Q04899 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdk18Q04899 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdk18Q04899 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdk18Q04899 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdk18Q04899 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdk18Q04899 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdk18Q04899 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdk18Q04899 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdk18Q04899 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdk18Q04899 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdk18Q04899 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdk18Q04899 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdk18Q04899 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdk18Q04899 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdk18Q04899 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdk18Q04899 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdk18Q04899 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdk18Q04899 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdk18Q04899 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdk18Q04899 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdk18Q04899 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdk18Q04899 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdk18Q04899 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdk18Q04899 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdk18Q04899 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdk18Q04899 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdk18Q04899 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdk18Q04899 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdk18Q04899 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdk18Q04899 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdk18Q04899 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdk18Q04899 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdk18Q04899 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cdk18Q04899 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cdk18Q04899 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cdk18Q04899 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cdk18Q04899 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cdk18Q04899 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cdk18Q04899 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cdk18Q04899 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdk18Q04899 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdk18Q04899 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdk18Q04899 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdk18Q04899 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdk18Q04899 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdk18Q04899 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdk18Q04899 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdk18Q04899 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdk18Q04899 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdk18Q04899 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdk18Q04899 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdk18Q04899 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdk18Q04899 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdk18Q04899 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdk18Q04899 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdk18Q04899 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdk18Q04899 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdk18Q04899 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdk18Q04899 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdk18Q04899 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdk18Q04899 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdk18Q04899 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdk18Q04899 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdk18Q04899 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdk18Q04899 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdk18Q04899 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdk18Q04899 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdk18Q04899 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdk18Q04899 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdk18Q04899 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdk18Q04899 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdk18Q04899 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdk18Q04899 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdk18Q04899 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdk18Q04899 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdk18Q04899 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdk18Q04899 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdk18Q04899 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms