Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms