Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Top1Q04750 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Top1Q04750 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Top1Q04750 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Top1Q04750 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Top1Q04750 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Top1Q04750 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Top1Q04750 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms