Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms