Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NfiaQ02780 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms