Protein–RNA interactions for Protein: Q02242

Pdcd1, Programmed cell death protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd1Q02242 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms