Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms