Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ascl1Q02067 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ascl1Q02067 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ascl1Q02067 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ascl1Q02067 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ascl1Q02067 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ascl1Q02067 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ascl1Q02067 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ascl1Q02067 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ascl1Q02067 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ascl1Q02067 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ascl1Q02067 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ascl1Q02067 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ascl1Q02067 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ascl1Q02067 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ascl1Q02067 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ascl1Q02067 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ascl1Q02067 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ascl1Q02067 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ascl1Q02067 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ascl1Q02067 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ascl1Q02067 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ascl1Q02067 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ascl1Q02067 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ascl1Q02067 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ascl1Q02067 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ascl1Q02067 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ascl1Q02067 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ascl1Q02067 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ascl1Q02067 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ascl1Q02067 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ascl1Q02067 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ascl1Q02067 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ascl1Q02067 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ascl1Q02067 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ascl1Q02067 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ascl1Q02067 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ascl1Q02067 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ascl1Q02067 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ascl1Q02067 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ascl1Q02067 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Ascl1Q02067 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ascl1Q02067 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ascl1Q02067 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ascl1Q02067 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Ascl1Q02067 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ascl1Q02067 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ascl1Q02067 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ascl1Q02067 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ascl1Q02067 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ascl1Q02067 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ascl1Q02067 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ascl1Q02067 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ascl1Q02067 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ascl1Q02067 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ascl1Q02067 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ascl1Q02067 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ascl1Q02067 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ascl1Q02067 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ascl1Q02067 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ascl1Q02067 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ascl1Q02067 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ascl1Q02067 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ascl1Q02067 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ascl1Q02067 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ascl1Q02067 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ascl1Q02067 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ascl1Q02067 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ascl1Q02067 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ascl1Q02067 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ascl1Q02067 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ascl1Q02067 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ascl1Q02067 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ascl1Q02067 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ascl1Q02067 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ascl1Q02067 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ascl1Q02067 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ascl1Q02067 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ascl1Q02067 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ascl1Q02067 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ascl1Q02067 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ascl1Q02067 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ascl1Q02067 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ascl1Q02067 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ascl1Q02067 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ascl1Q02067 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ascl1Q02067 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ascl1Q02067 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ascl1Q02067 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ascl1Q02067 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ascl1Q02067 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ascl1Q02067 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ascl1Q02067 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ascl1Q02067 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ascl1Q02067 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ascl1Q02067 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ascl1Q02067 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ascl1Q02067 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ascl1Q02067 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ascl1Q02067 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms