Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
VcpQ01853 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
VcpQ01853 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
VcpQ01853 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VcpQ01853 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
VcpQ01853 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VcpQ01853 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VcpQ01853 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VcpQ01853 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VcpQ01853 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VcpQ01853 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VcpQ01853 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VcpQ01853 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VcpQ01853 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms