Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms