Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms