Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms