Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Grin2bQ01097 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Grin2bQ01097 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Grin2bQ01097 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Grin2bQ01097 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Grin2bQ01097 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Grin2bQ01097 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Grin2bQ01097 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Grin2bQ01097 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Grin2bQ01097 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Grin2bQ01097 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Grin2bQ01097 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Grin2bQ01097 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Grin2bQ01097 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Grin2bQ01097 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Grin2bQ01097 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Grin2bQ01097 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Grin2bQ01097 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Grin2bQ01097 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Grin2bQ01097 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Grin2bQ01097 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Grin2bQ01097 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Grin2bQ01097 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Grin2bQ01097 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Grin2bQ01097 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Grin2bQ01097 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Grin2bQ01097 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Grin2bQ01097 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Grin2bQ01097 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Grin2bQ01097 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Grin2bQ01097 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Grin2bQ01097 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Grin2bQ01097 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Grin2bQ01097 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Grin2bQ01097 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Grin2bQ01097 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Grin2bQ01097 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Grin2bQ01097 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Grin2bQ01097 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Grin2bQ01097 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Grin2bQ01097 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Grin2bQ01097 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Grin2bQ01097 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Grin2bQ01097 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Grin2bQ01097 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Grin2bQ01097 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Grin2bQ01097 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Grin2bQ01097 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Grin2bQ01097 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Grin2bQ01097 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Grin2bQ01097 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Grin2bQ01097 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Grin2bQ01097 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Grin2bQ01097 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Grin2bQ01097 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Grin2bQ01097 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Grin2bQ01097 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Grin2bQ01097 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Grin2bQ01097 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Grin2bQ01097 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Grin2bQ01097 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Grin2bQ01097 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Grin2bQ01097 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Grin2bQ01097 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Grin2bQ01097 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Grin2bQ01097 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Grin2bQ01097 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Grin2bQ01097 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Grin2bQ01097 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Grin2bQ01097 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Grin2bQ01097 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Grin2bQ01097 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Grin2bQ01097 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Grin2bQ01097 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Grin2bQ01097 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Grin2bQ01097 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Grin2bQ01097 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Grin2bQ01097 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Grin2bQ01097 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Grin2bQ01097 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Grin2bQ01097 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Grin2bQ01097 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Grin2bQ01097 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Grin2bQ01097 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Grin2bQ01097 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Grin2bQ01097 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Grin2bQ01097 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Grin2bQ01097 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Grin2bQ01097 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Grin2bQ01097 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Grin2bQ01097 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Grin2bQ01097 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Grin2bQ01097 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Grin2bQ01097 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Grin2bQ01097 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Grin2bQ01097 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Grin2bQ01097 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Grin2bQ01097 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Grin2bQ01097 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Grin2bQ01097 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms