Protein–RNA interactions for Protein: Q00731

Vegfa, Vascular endothelial growth factor A, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfaQ00731 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VegfaQ00731 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms