Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SeleQ00690 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
SeleQ00690 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SeleQ00690 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms