Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms