Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AlkP97793 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AlkP97793 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AlkP97793 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AlkP97793 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
AlkP97793 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AlkP97793 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
AlkP97793 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
AlkP97793 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
AlkP97793 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
AlkP97793 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AlkP97793 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AlkP97793 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AlkP97793 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AlkP97793 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AlkP97793 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AlkP97793 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AlkP97793 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AlkP97793 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AlkP97793 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AlkP97793 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AlkP97793 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AlkP97793 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
AlkP97793 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AlkP97793 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
AlkP97793 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AlkP97793 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AlkP97793 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AlkP97793 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AlkP97793 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AlkP97793 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AlkP97793 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AlkP97793 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AlkP97793 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AlkP97793 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AlkP97793 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
AlkP97793 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AlkP97793 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AlkP97793 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
AlkP97793 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
AlkP97793 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
AlkP97793 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AlkP97793 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AlkP97793 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AlkP97793 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AlkP97793 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AlkP97793 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AlkP97793 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AlkP97793 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AlkP97793 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AlkP97793 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AlkP97793 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AlkP97793 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
AlkP97793 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AlkP97793 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AlkP97793 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AlkP97793 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AlkP97793 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
AlkP97793 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AlkP97793 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AlkP97793 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AlkP97793 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AlkP97793 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AlkP97793 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AlkP97793 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AlkP97793 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AlkP97793 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
AlkP97793 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AlkP97793 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
AlkP97793 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AlkP97793 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AlkP97793 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AlkP97793 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AlkP97793 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AlkP97793 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AlkP97793 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AlkP97793 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AlkP97793 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
AlkP97793 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
AlkP97793 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AlkP97793 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AlkP97793 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AlkP97793 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
AlkP97793 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AlkP97793 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
AlkP97793 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
AlkP97793 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
AlkP97793 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
AlkP97793 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
AlkP97793 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
AlkP97793 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AlkP97793 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AlkP97793 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AlkP97793 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AlkP97793 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AlkP97793 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
AlkP97793 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AlkP97793 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AlkP97793 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AlkP97793 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms