Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Pitx2P97474 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pitx2P97474 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pitx2P97474 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pitx2P97474 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pitx2P97474 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pitx2P97474 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pitx2P97474 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pitx2P97474 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pitx2P97474 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pitx2P97474 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pitx2P97474 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pitx2P97474 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pitx2P97474 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pitx2P97474 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pitx2P97474 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pitx2P97474 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pitx2P97474 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pitx2P97474 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pitx2P97474 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pitx2P97474 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pitx2P97474 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pitx2P97474 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pitx2P97474 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pitx2P97474 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pitx2P97474 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pitx2P97474 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pitx2P97474 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pitx2P97474 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pitx2P97474 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pitx2P97474 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pitx2P97474 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pitx2P97474 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pitx2P97474 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pitx2P97474 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pitx2P97474 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pitx2P97474 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pitx2P97474 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pitx2P97474 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pitx2P97474 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pitx2P97474 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Pitx2P97474 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pitx2P97474 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pitx2P97474 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pitx2P97474 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Pitx2P97474 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Pitx2P97474 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Pitx2P97474 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pitx2P97474 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pitx2P97474 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pitx2P97474 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pitx2P97474 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pitx2P97474 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pitx2P97474 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pitx2P97474 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pitx2P97474 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pitx2P97474 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pitx2P97474 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pitx2P97474 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pitx2P97474 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pitx2P97474 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pitx2P97474 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pitx2P97474 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pitx2P97474 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pitx2P97474 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pitx2P97474 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pitx2P97474 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pitx2P97474 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pitx2P97474 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pitx2P97474 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pitx2P97474 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pitx2P97474 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pitx2P97474 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pitx2P97474 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pitx2P97474 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pitx2P97474 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pitx2P97474 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pitx2P97474 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pitx2P97474 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pitx2P97474 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Pitx2P97474 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pitx2P97474 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pitx2P97474 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pitx2P97474 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pitx2P97474 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Pitx2P97474 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms