Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nbr1P97432 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nbr1P97432 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nbr1P97432 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nbr1P97432 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nbr1P97432 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nbr1P97432 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nbr1P97432 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Nbr1P97432 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nbr1P97432 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nbr1P97432 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nbr1P97432 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nbr1P97432 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nbr1P97432 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nbr1P97432 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nbr1P97432 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nbr1P97432 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Nbr1P97432 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nbr1P97432 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nbr1P97432 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nbr1P97432 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nbr1P97432 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nbr1P97432 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nbr1P97432 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nbr1P97432 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nbr1P97432 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nbr1P97432 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nbr1P97432 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nbr1P97432 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nbr1P97432 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nbr1P97432 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nbr1P97432 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms