Protein–RNA interactions for Protein: P97390

Vps45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps45P97390 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps45P97390 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps45P97390 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps45P97390 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps45P97390 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vps45P97390 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vps45P97390 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vps45P97390 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vps45P97390 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vps45P97390 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vps45P97390 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Vps45P97390 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Vps45P97390 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Vps45P97390 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Vps45P97390 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Vps45P97390 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vps45P97390 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Vps45P97390 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vps45P97390 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vps45P97390 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vps45P97390 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vps45P97390 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vps45P97390 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vps45P97390 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vps45P97390 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vps45P97390 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vps45P97390 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vps45P97390 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vps45P97390 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vps45P97390 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vps45P97390 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vps45P97390 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vps45P97390 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vps45P97390 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vps45P97390 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vps45P97390 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vps45P97390 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vps45P97390 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vps45P97390 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vps45P97390 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Vps45P97390 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vps45P97390 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vps45P97390 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vps45P97390 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vps45P97390 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vps45P97390 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Vps45P97390 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vps45P97390 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vps45P97390 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms