Protein–RNA interactions for Protein: P86448

Trim43b, Tripartite motif-containing protein 43B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43bP86448 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim43bP86448 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim43bP86448 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim43bP86448 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim43bP86448 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim43bP86448 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim43bP86448 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim43bP86448 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim43bP86448 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim43bP86448 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim43bP86448 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim43bP86448 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim43bP86448 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim43bP86448 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim43bP86448 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim43bP86448 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim43bP86448 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim43bP86448 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim43bP86448 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim43bP86448 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim43bP86448 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim43bP86448 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim43bP86448 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim43bP86448 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim43bP86448 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim43bP86448 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim43bP86448 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim43bP86448 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim43bP86448 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim43bP86448 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim43bP86448 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim43bP86448 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim43bP86448 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim43bP86448 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim43bP86448 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim43bP86448 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim43bP86448 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim43bP86448 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim43bP86448 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim43bP86448 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim43bP86448 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim43bP86448 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim43bP86448 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim43bP86448 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim43bP86448 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim43bP86448 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim43bP86448 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim43bP86448 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim43bP86448 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim43bP86448 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim43bP86448 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim43bP86448 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim43bP86448 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim43bP86448 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim43bP86448 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim43bP86448 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim43bP86448 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim43bP86448 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim43bP86448 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim43bP86448 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim43bP86448 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim43bP86448 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim43bP86448 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim43bP86448 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim43bP86448 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim43bP86448 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim43bP86448 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim43bP86448 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim43bP86448 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim43bP86448 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim43bP86448 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim43bP86448 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim43bP86448 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim43bP86448 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim43bP86448 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim43bP86448 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim43bP86448 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim43bP86448 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim43bP86448 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim43bP86448 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim43bP86448 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim43bP86448 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim43bP86448 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim43bP86448 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim43bP86448 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim43bP86448 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim43bP86448 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim43bP86448 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim43bP86448 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim43bP86448 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim43bP86448 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim43bP86448 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim43bP86448 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim43bP86448 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim43bP86448 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim43bP86448 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim43bP86448 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim43bP86448 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim43bP86448 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim43bP86448 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms