Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
H3f3aP84244 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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