Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Arf1P84078 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Arf1P84078 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Arf1P84078 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Arf1P84078 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Arf1P84078 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Arf1P84078 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Arf1P84078 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Arf1P84078 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Arf1P84078 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Arf1P84078 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Arf1P84078 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Arf1P84078 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Arf1P84078 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Arf1P84078 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Arf1P84078 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Arf1P84078 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Arf1P84078 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Arf1P84078 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Arf1P84078 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Arf1P84078 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Arf1P84078 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Arf1P84078 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Arf1P84078 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Arf1P84078 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Arf1P84078 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Arf1P84078 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Arf1P84078 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Arf1P84078 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Arf1P84078 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Arf1P84078 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Arf1P84078 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Arf1P84078 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Arf1P84078 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Arf1P84078 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Arf1P84078 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Arf1P84078 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Arf1P84078 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Arf1P84078 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arf1P84078 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arf1P84078 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arf1P84078 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Arf1P84078 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms