Protein–RNA interactions for Protein: P82348

Sgcg, Gamma-sarcoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcgP82348 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgcgP82348 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SgcgP82348 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgcgP82348 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgcgP82348 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgcgP82348 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms