Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smad1P70340 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad1P70340 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad1P70340 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Smad1P70340 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smad1P70340 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smad1P70340 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms