Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cux2P70298 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cux2P70298 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cux2P70298 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Cux2P70298 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cux2P70298 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cux2P70298 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cux2P70298 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cux2P70298 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cux2P70298 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cux2P70298 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Cux2P70298 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cux2P70298 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cux2P70298 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cux2P70298 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cux2P70298 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cux2P70298 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Cux2P70298 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Cux2P70298 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Cux2P70298 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cux2P70298 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cux2P70298 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cux2P70298 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cux2P70298 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cux2P70298 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cux2P70298 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Cux2P70298 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cux2P70298 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cux2P70298 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Cux2P70298 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Cux2P70298 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cux2P70298 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cux2P70298 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cux2P70298 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cux2P70298 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cux2P70298 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cux2P70298 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cux2P70298 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cux2P70298 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cux2P70298 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cux2P70298 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cux2P70298 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cux2P70298 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cux2P70298 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cux2P70298 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cux2P70298 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Cux2P70298 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cux2P70298 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cux2P70298 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cux2P70298 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Cux2P70298 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cux2P70298 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cux2P70298 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cux2P70298 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cux2P70298 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cux2P70298 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cux2P70298 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cux2P70298 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cux2P70298 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cux2P70298 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cux2P70298 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cux2P70298 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cux2P70298 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cux2P70298 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cux2P70298 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cux2P70298 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cux2P70298 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cux2P70298 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cux2P70298 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cux2P70298 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cux2P70298 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cux2P70298 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Cux2P70298 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cux2P70298 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cux2P70298 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cux2P70298 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cux2P70298 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cux2P70298 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cux2P70298 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cux2P70298 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cux2P70298 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cux2P70298 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cux2P70298 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cux2P70298 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cux2P70298 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cux2P70298 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cux2P70298 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Cux2P70298 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cux2P70298 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Cux2P70298 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cux2P70298 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cux2P70298 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cux2P70298 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cux2P70298 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cux2P70298 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cux2P70298 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cux2P70298 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cux2P70298 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cux2P70298 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cux2P70298 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms