Protein–RNA interactions for Protein: P70255

Nfic, Nuclear factor 1 C-type, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NficP70255 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NficP70255 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NficP70255 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NficP70255 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NficP70255 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NficP70255 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NficP70255 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NficP70255 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NficP70255 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NficP70255 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NficP70255 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NficP70255 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NficP70255 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NficP70255 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NficP70255 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NficP70255 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NficP70255 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NficP70255 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NficP70255 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NficP70255 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NficP70255 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NficP70255 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NficP70255 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NficP70255 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NficP70255 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NficP70255 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NficP70255 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NficP70255 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NficP70255 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NficP70255 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NficP70255 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NficP70255 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NficP70255 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NficP70255 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NficP70255 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NficP70255 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NficP70255 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NficP70255 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NficP70255 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NficP70255 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NficP70255 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NficP70255 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NficP70255 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NficP70255 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NficP70255 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NficP70255 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NficP70255 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NficP70255 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NficP70255 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NficP70255 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NficP70255 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NficP70255 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NficP70255 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NficP70255 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NficP70255 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NficP70255 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NficP70255 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NficP70255 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NficP70255 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NficP70255 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NficP70255 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NficP70255 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NficP70255 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NficP70255 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NficP70255 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NficP70255 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NficP70255 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NficP70255 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NficP70255 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NficP70255 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NficP70255 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NficP70255 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NficP70255 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NficP70255 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NficP70255 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NficP70255 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NficP70255 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NficP70255 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NficP70255 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NficP70255 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NficP70255 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NficP70255 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NficP70255 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NficP70255 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NficP70255 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NficP70255 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NficP70255 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NficP70255 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NficP70255 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NficP70255 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NficP70255 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NficP70255 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NficP70255 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NficP70255 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NficP70255 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NficP70255 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NficP70255 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NficP70255 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NficP70255 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NficP70255 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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