Protein–RNA interactions for Protein: P70208

Plxna3, Plexin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxna3P70208 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Plxna3P70208 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Plxna3P70208 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Plxna3P70208 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Plxna3P70208 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Plxna3P70208 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Plxna3P70208 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Plxna3P70208 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Plxna3P70208 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Plxna3P70208 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Plxna3P70208 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Plxna3P70208 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Plxna3P70208 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Plxna3P70208 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Plxna3P70208 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Plxna3P70208 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Plxna3P70208 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Plxna3P70208 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Plxna3P70208 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Plxna3P70208 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Plxna3P70208 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Plxna3P70208 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Plxna3P70208 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Plxna3P70208 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Plxna3P70208 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Plxna3P70208 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Plxna3P70208 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Plxna3P70208 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Plxna3P70208 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Plxna3P70208 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Plxna3P70208 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Plxna3P70208 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Plxna3P70208 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Plxna3P70208 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Plxna3P70208 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Plxna3P70208 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Plxna3P70208 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Plxna3P70208 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Plxna3P70208 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Plxna3P70208 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Plxna3P70208 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Plxna3P70208 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Plxna3P70208 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Plxna3P70208 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Plxna3P70208 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Plxna3P70208 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Plxna3P70208 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Plxna3P70208 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Plxna3P70208 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Plxna3P70208 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Plxna3P70208 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Plxna3P70208 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Plxna3P70208 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Plxna3P70208 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Plxna3P70208 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Plxna3P70208 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Plxna3P70208 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Plxna3P70208 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Plxna3P70208 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Plxna3P70208 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Plxna3P70208 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Plxna3P70208 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Plxna3P70208 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Plxna3P70208 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Plxna3P70208 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Plxna3P70208 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Plxna3P70208 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Plxna3P70208 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Plxna3P70208 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Plxna3P70208 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Plxna3P70208 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Plxna3P70208 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Plxna3P70208 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Plxna3P70208 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Plxna3P70208 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Plxna3P70208 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Plxna3P70208 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Plxna3P70208 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Plxna3P70208 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Plxna3P70208 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Plxna3P70208 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Plxna3P70208 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Plxna3P70208 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Plxna3P70208 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Plxna3P70208 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Plxna3P70208 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Plxna3P70208 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Plxna3P70208 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Plxna3P70208 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Plxna3P70208 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Plxna3P70208 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Plxna3P70208 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Plxna3P70208 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Plxna3P70208 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Plxna3P70208 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Plxna3P70208 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Plxna3P70208 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Plxna3P70208 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Plxna3P70208 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Plxna3P70208 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms