Protein–RNA interactions for Protein: P62320

Snrpd3, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd3P62320 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms