Protein–RNA interactions for Protein: P61219

Polr2f, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2fP61219 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr2fP61219 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr2fP61219 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr2fP61219 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr2fP61219 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr2fP61219 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr2fP61219 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr2fP61219 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr2fP61219 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr2fP61219 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr2fP61219 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr2fP61219 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr2fP61219 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr2fP61219 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr2fP61219 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr2fP61219 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr2fP61219 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr2fP61219 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr2fP61219 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr2fP61219 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr2fP61219 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr2fP61219 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr2fP61219 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr2fP61219 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr2fP61219 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr2fP61219 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr2fP61219 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr2fP61219 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr2fP61219 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr2fP61219 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr2fP61219 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr2fP61219 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr2fP61219 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr2fP61219 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr2fP61219 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr2fP61219 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Polr2fP61219 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Polr2fP61219 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr2fP61219 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr2fP61219 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr2fP61219 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr2fP61219 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr2fP61219 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr2fP61219 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr2fP61219 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr2fP61219 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr2fP61219 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr2fP61219 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr2fP61219 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr2fP61219 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr2fP61219 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr2fP61219 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr2fP61219 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr2fP61219 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr2fP61219 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr2fP61219 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr2fP61219 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr2fP61219 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr2fP61219 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr2fP61219 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr2fP61219 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr2fP61219 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr2fP61219 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr2fP61219 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr2fP61219 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr2fP61219 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr2fP61219 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr2fP61219 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr2fP61219 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr2fP61219 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr2fP61219 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr2fP61219 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr2fP61219 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr2fP61219 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr2fP61219 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr2fP61219 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr2fP61219 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr2fP61219 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr2fP61219 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr2fP61219 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr2fP61219 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr2fP61219 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr2fP61219 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr2fP61219 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr2fP61219 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr2fP61219 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr2fP61219 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr2fP61219 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr2fP61219 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr2fP61219 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr2fP61219 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr2fP61219 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr2fP61219 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr2fP61219 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Polr2fP61219 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Polr2fP61219 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Polr2fP61219 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Polr2fP61219 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Polr2fP61219 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Polr2fP61219 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms